El FONDAM lleva a cabo todas sus actividades con absoluta transparencia. En todas las convocatorias que realiza se establecen procedimientos y criterios técnicos que garantizan la idoneidad de todos los procesos establecidos antes de llegar a la nómina definitiva de ganadores.
Los procesos de consulta durante una convocatoria se realizan por escrito en las fechas establecidas, siendo el Comité Técnico del FONDAM el único ente responsable y autorizado de absolverlas. El personal del FONDAM está prohibido de responder cualquier consulta, duda u observación, que no sea canalizada por los mecanismos previamente definidos.
De acuerdo a lo establecido en su reglamento, el FONDAM es evaluado en sus actividades realizadas y en sus cuentas administrativas mediante una auditoría anual externa realizada por una empresa auditora independiente de acuerdo a los estándares internacionales. Durante el período 2001 - 2005 la Firma Price Waterhouse Cooper llevó a cabo las auditorías correspondientes, dictaminando de la forma siguiente:
"En nuestra opinión, los estados financieros antes indicados presentan razonablemente, en todos sus aspectos significativos, la situación financiera del Fondo de las Américas del Perú al 31 de diciembre del año 2001 - 2005, los resultados de su gestión y sus flujos de efectivo por el año terminado en esa fecha, de acuerdo con principios de contabilidad generalmente aceptados".
Adicionalmente, durante el mes de julio de 2003, el Fondo de las Américas del Perú recibió al equipo de evaluadores de USAID-USA (United States Agency for International Development) y WWF-US (World Wildlife Fund), en el marco del Programa General de Evaluaciones que se realizan a los Fondos de las Américas. El citado equipo expresó su complacencia por el trabajo efectuado y por los avances alcanzados hasta la fecha.
Igualmente, de acuerdo a lo estipulado en su mandato, el FONDAM presenta un informe Anual de Gestión a los Gobiernos Fundadores, donde se muestran las principales tareas desarrolladas por nuestra institución a lo largo del año precedente.
